Sou um médico cientista. Desenvolvo ferramentas para análise e interpretação de conjuntos de dados biomédicos complexos. Os carros-chefe são:
- TopoMetry, ferramenta para caracterizar e explorar a geometria latente de dados de alta dimensionalidade, tais como dados de para sequenciamento de RNA de célula única (single-cell RNA-seq)
- 3DLightViewer (tdlv), ferramenta de análise de dados de tomografia óptica obtidos de amostras biológicas submetidas a clareamento tecidual e microscopia de lençol de luz.
Você me encontra no Instagram e me alcança por lá ou por email.
I'm a physician-scientist. I develop tools for the analysis and interpretation of large biomedical data. I was a postdoc at the Ana Domingos' lab at the University of Oxford, where I worked on providing a molecular, neuroanatomical, and functional characterization of the sympathetic nervous system.
My repos are a collection of tools I developed to understand and interpret high-dimensional data, and of specific projects using these tools for analyzing single-cell data. The highlight is TopoMetry, a toolkit for geometric exploration of high-dimensional data with specialized functionalities and workflows tailored for single-cell data.